عكف جهاز المخابرات العامة على تكثيف التعاون المشترك مع دول المصدر (الدول الأم) ودول المعبر ودول المقصد (التي تعتبر غاية اللاجئين وهى فى أغلب الأحوال الدول الأوربية) وذلك من خلال تبادل المعلومات الاستخباراتية حول المهربين وشبكات التهريب والطرق التي يسلكونها والمخابئ التي يلجأون إليها؛ ويقيم جهاز المخابرات العامة علاقات تعاون وثيقة في مجال مكافحة الهجرة غير الشرعية والاتجار بالبشر مع بعض أجهزة المخابرات العالمية .

إن جريمة الإتجار بالبشر والهجرة غير الشرعية هي جريمة عابرة للحدود الدولية؛ لذا تقتضي مكافحتها التعاون الدولي، من خلال الانضمام للمنظمات والمعاهدات الدولية والخاصة بمكافحة الإتجار بالبشر والهجرة غير الشرعية ٠

• تتمثل الجهود التي يقوم بها جهاز المخابرات العامة في مكافحة هذه الظاهرة في الآتي :-
• توفير معلومات جيدة عن العصابات وأساليب إدارتهم لعمليات الهجرة والإتجار في البشر والمخابئ المستخدمة في تخزين الرهائن ومتابعة المشتبه بهم من العاملين في مجال تجارة وتهريب البشر ٠
• التنسيق مع القوات الأخرى وإبعاد عدد من العناصر التي تعمل في الإتجار بالبشر  إلى بلدانهم ٠
• ساهم الجهاز في وضع استراتيجية السودان لمكافحة تهريب والإتجار بالبشر
• التعاون مع الأجهزة الصديقة خاصة أجهزة مخابرات الدول ذات الحدود المشتركة من أجل ضبط الحدود.
• المشاركة في كل المؤتمرات وورش العمل الخاصة بهذه الظاهرة  ٠

التحديات التى تواجه السودان في مكافحة الهجرة غير الشرعية

• هنالك تحديات كبيرة أمام جهود السودان في مكافحة هذا التدفق البشري أهمها :
• ارتباط الظاهرة بأكثر من دولة وتجاهل بعض الحكومات لها  والحروب الأهلية والكوارث في بعض الدول .

2)    ضعف الإمكانيات المادية والبشرية لدى معسكرات اللاجئين الحدودية ٠

• صعوبة متابعة عصابات الهجرة غير الشرعية والتكاليف الباهظة لعمليات المتابعة والمطاردة والايواء والعلاج لهذه الاعداد الكبيرة .